紅樹灣站位于深圳市白石三道與深灣一路交叉口東側路面下方，靠白石三道南側呈東西向布設。中信紅樹灣高檔住宅區位于車站北側，紅樹西岸位于車站西側，海濱實驗小學紅樹西岸部位于車站西南側。該站為地下站出入口信息A出口：梨園路、白石三道南側、深灣一路B出口：深圳市海濱實驗小學、白石三道南側D出口：白石四道、白石三道北側、深灣一路、沙河天虹、京基百納廣場公交換乘信息地鐵出口：D公交站名：海濱實驗小學(約100米)58、109、B610地鐵出口：D公交站名：沙河東公交總站(約10米)B795